S2 E1 • Un monde de chaos

Alors que l'USS Nathan James est pris d'assaut par des hommes armés d'Avocet, et ses marins faits prisonniers, Chandler, avec l'aide de son équipe à terre, réussit à retrouver et sauver ses enfants. Pendant que l'un tente activement de mettre la main sur la souche originelle du vaccin, l'autre met tout en œuvre pour arrêter ce carnage. C'est ainsi que Chandler fait la rencontre des Seigneurs de Guerre qui luttent pour la même cause. Ils s'unissent alors pour vaincre Amy Granderson. Au même moment, le Docteur Scott, toujours prisonnière d'Avocet, tente de venir en aide aux survivants...

Première diffusion : 21 juin 2015

S2 E2 • Rébellion

À la centrale électrique, Chandler, son équipe et les Seigneurs de Guerre sont prêts à couper le courant et prendre d'assaut Avocet afin de mettre hors d'état de nuire Granderson et mettre fin au carnage. Le Docteur Scott et Tex en profitent alors pour délivrer Kara et la sauve in extremis. Au même moment, à bord de l'USS Nathan James, la rébellion se met en place et l'équipage reprend le navire en main...

Première diffusion : 21 juin 2015

S2 E3 • L'Arche du commandant

À Baltimore, le Docteur Scott recrée des milliers de doses de vaccins. Suite à un message crypté du secrétaire de la Marine, Chandler et elle décident d'aller jusqu'à Norfolk afin de trouver des ressources nécessaires qui permettront à des laboratoires du monde entier, restés protégés et en état, de produire des vaccins. Sur place, certains membres d'équipage tentent de retrouver leur famille. À Port St. Lucie, le porteur sain du virus rencontre un groupe de survivants qui pensent être des élus...

Première diffusion : 28 juin 2015

S2 E4 • Solace

Le «Nathan James» part à la recherche d'un navire hôpital qui croise à proximité et à bord duquel se trouvent médecins, matériel et des pirates.

Première diffusion : 5 juillet 2015

S2 E5 • Bataille navale

Le «Nathan James» traque le sous-marin des pirates qui ont pris d'assaut le «Solace». Une furieuse bataille navale s'engage quand il le retrouve.

Première diffusion : 12 juillet 2015

S2 E6 • Advienne que pourra

Chandler poursuit une nouvelle menace dans le nord de la Floride. Pendant ce temps, Rachel tombe sur une formule secrète que son mentor, le Dr Hunter, a perfectionné.

Première diffusion : 19 juillet 2015

S2 E7 • Les infiltrés

Dans le camp où tous les immunisés se regroupent, Chandler et ses hommes tentent de ne se pas faire repérer. Green découvre que Niels collabore avec Sean et son frère. Pendant ce temps, sur le « Nathan James », Rachel expérimente le vaccin en poudre sur des souris. Aidé de Ravit et Burk, Chandler sauve le nouveau président des Etats-Unis d'une fausse alerte à la bombe et parvient à se faire engager en tant que garde du corps.

Première diffusion : 26 juillet 2015

S2 E8 • La voie de la rédemption

En tentant toujours de reconstituer la formule perdue du Dr Hunter, Rachel est aux prises avec le fait que Niels, son ennemi juré, est maintenant à bord du "Nathan James", tandis que Chandler travaille pour gagner la confiance et convaincre Michener que les vrais ennemis sont les Ramseys.

Première diffusion : 2 août 2015

S2 E9 • Les enfants soldats

Une fois remis de ses blessures, Niels demande à parler au Docteur Scott. Elle refuse tout d'abord, puis accepte car elle a besoin de son aide et de ses connaissances. Elle recherche une solution pour vaporiser le vaccin et a besoin de la séquence de stabilisation du virus. Au même moment, Chandler et son équipe se rendent sur la terre ferme et croisent une bande d'adolescents armés. Ils apprennent alors que les immunisés ont mis une prime sur leur tête.

Première diffusion : 9 août 2015

S2 E10 • Du sang sur les mains

À bord de l'«USS Nathan James», une enquête est ouverte sur la mort suspecte de Niels et une autre afin de savoir à quoi servent les téléphones retrouvés sur les «immunisés» puisque les réseaux de communication sont hors-service. Pendant ce temps, le navire continue de faire route vers la Nouvelle-Orléans. Le Docteur Scott poursuit ses tests pour élaborer un remède contagieux.

Première diffusion : 16 août 2015

S2 E11 • Valkyrie

Les hommes du « James » tentent de sauver les victimes de l'explosion de la flotte. Mais Ramsey diffuse une autre vidéo truquée. Il annonce que le virus est en fait une création de la marine américaine et demande à tous ses auditeurs de pourchasser Chandler. Michener propose de partir à la recherche de Valkyrie, la personne qui diffuse les vidéos. Les marines la trouvent sur une plateforme pétrolière et lancent l'assaut.

Première diffusion : 23 août 2015

S2 E12 • Un espoir menacé

Le sous-marin de Sean Ramsey se rapproche de plus en plus du « Nathan James ». Chandler est décidé à l'affronter. Pour leur éviter de prendre des risques, il ordonne de faire descendre le président, les enfants et Rachel à terre. Pour plus de sécurité, Slattery et l'équipe d'intervention les accompagnent. Sauvée de l'explosion de la plateforme, Val accepte d'aider la marine à diffuser un faux message sur son réseau.

Première diffusion : 30 août 2015

S2 E13 • Sauver les hommes

Via un message vidéo, le président Michener annonce à la population américaine que le vaccin sera distribué dans des ports du Mississippi. L'équipage du « Nathan James » est chargé de répandre le vaccin. Mais à la première escale, seuls quelques rares civils paraissent. Et McDowell, un disciple de Ramsey, menace le président et l'opération. Il déguise ses hommes en militaires... A terre, Tex part à la recherche de sa fille.

Première diffusion : 6 septembre 2015