The Amazing Spider-Man

Alors enfant, Peter Parker joue à cache-cache avec ses parents quand il découvre que le bureau de son père, biologiste, a été cambriolé. Quand il le voit, Richard Parker, le père de Peter, récupère à la va-vite quelques documents dans un tiroir secret avant d'amener son fils à la maison de ceux qui deviendront pour le garçon Oncle Ben et Tante May. Richard Parker disparaît un peu plus tard avec sa femme.

Des années après ces évènements, Peter est lycéen au Midtown Science High School, où il vit entre les brutalités de Flash Thompson dont il est le souffre-douleur et ses sentiments pour Gwen Stacy. Un soir, de retour chez lui, il découvre dans la cave la mallette de son père, dans laquelle se trouvent encore les documents récupérés la nuit de sa disparition. Oncle Ben lui donne le nom de l'homme amputé du bras droit qu'on voit aux côtés de Richard Parker sur une photo : le docteur Curtis Connors, maintenant scientifique pour Oscorp.

Peter s'infiltre dans les laboratoires en se mêlant à un groupe de stagiaires et découvre que Gwen y travaille comme assistante. Il ne parvient pas à parler avec le docteur mais décide de le suivre et s'infiltre dans un laboratoire où une forme de câble résistant est fabriquée par des araignées génétiquement modifiées ; l'une d'entre elles le mord avant qu'il ne soit expulsé. Sur le chemin du retour, dans le métro, Peter se découvre de nouvelles capacités : une force et une agilité accrue ainsi que la possibilité de s'accrocher à n'importe quelle surface.

Peter étudie par la suite les documents de son père et découvre une formule, un « algorithme de régression », qu'il donne au docteur Connors lors d'une visite à son domicile. Cette formule est la pièce manquante aux recherches de Connors sur la régénération de membres perdus. Connors souhaite avancer progressivement dans les tests mais le docteur Ratha le force à tester son produit sur des humains afin de soigner au plus vite son employeur mourant, qui n'est autre que Norman Osborn.

Peter Parker profite de ses nouvelles capacités pour se venger de Flash, ce qui lui vaut des sanctions disciplinaires et des remontrances de son oncle. Forcé de partir en déplacement, il demande à Peter d'aller chercher sa tante en ville pendant qu'il travaille, mais Peter passe sa soirée avec Connors à Oscorp, où ils testent la substance sur une souris amputée. Quand Peter rentre chez lui, Ben est en colère car il a oublié sa tante May. Peter s'enfuit, en colère, et Ben part à sa recherche en ville. Il se retrouve face à un voleur que Peter vient juste de laisser filer avec son butin, et quand le voleur sort une arme, les deux hommes se battent et Ben reçoit une balle mortelle dans le ventre. Le voleur fuit et Peter hurle à l'aide.

Peter décide par la suite de traquer le criminel en se basant sur un portrait robot et utilise ses nouvelles capacités pour cela. Dans sa première nuit de recherche, il est vite poursuivi et finit par tomber dans une salle de sport abandonnée, où il voit un poster montrant un masque de luchador, qui lui inspire le dessin de son propre masque. Il se dessine un costume avec une combinaison en élasthane, et des appareils qu'il attache à ses poignets pour projeter un biocable sous forme d'une toile. Peter se fait ainsi un costume bleu et rouge avec un dessin d'araignée et se voit attribuer un nom par la presse : Spider-Man. Parallèlement, Peter est invité par Gwen à dîner avec sa famille, où il se dispute avec le père de Gwen, chef de la police de New York. Seul ensuite avec Gwen, il lui révèle sa double identité et l'embrasse.

Ratha force Connors à poursuivre les tests sur des humains immédiatement car Osborn ne pourra pas survivre encore bien longtemps. Connors refuse et Ratha le licencie avant de récupérer le produit pour le tester sur des vétérans de guerre, en le faisant passer pour un vaccin contre la grippe. Connors essaie alors la formule en se l'injectant dans son bras amputé. Après s'être évanoui, il voit son bras régénéré, mais quand il apprend que Ratha est en route pour l'hôpital, Connors part à sa poursuite, malgré le changement de sa peau qui se couvre d'écailles vertes. Il prend ainsi une forme de lézard humanoïde géant, renverse des voitures et retrouve Ratha sur le Williamsburg Bridge embouché. Peter, ayant entendu les sirènes de police, rejoint les lieux et met en fuite le Lézard, puis sauve un jeune garçon d'une chute mortelle.

Spider-Man suspecte vite Connors d'être le Lézard, mais ne convainc pas le capitaine Stacy. Il tente donc de le prouver en le cherchant dans les égouts, mais c'est le Lézard qui l'attaque et découvre l'identité de Spider-Man. Il tente donc de l'affronter au lycée de Peter, sans succès. La police traque dès lors Spider-Man et le Lézard.

Peter trouve le repaire de Connors dans les égouts et découvre son plan : lancer un nuage de gaz chimique depuis le sommet de la tour Oscorp pour provoquer des changements génétiques similaires aux siens. Spider-Man tente de rejoindre la tour au plus vite, sachant que Gwen s'y trouve et assemble un antidote au produit de Connors. Il convainc la police de le suivre en révélant au capitaine Stacy son identité, puis parvient à rejoindre la tour avec l'aide du père du garçon sauvé sur le pont. Au terme d'un combat au sommet du bâtiment, Peter réussit à remplacer le produit de Connors par l'antidote, et le nuage répandu annule les changements chez Connors et ses victimes. Mais le capitaine Stacy, blessé mortellement par le Lézard, ne peut que faire promettre à Peter de laisser Gwen hors de ses combats en s'éloignant d'elle. Peter accepte mais au lycée, quand un professeur lui dit de ne pas faire de promesse qu'il ne peut tenir, Peter glisse à Gwen que ces promesses là sont les meilleures et qu'il ne peut donc pas l'ignorer.

Dans une scène pendant le générique de fin, Connors, emprisonné, parle avec un homme dans sa cellule qui lui demande s'il a révélé la vérité sur le père de Peter Parker. Connors répond que non avant de demander à son interlocuteur de laisser Peter en paix, mais il a déjà disparu.