S3 E1 • Il suffit d'y croire

Tandis que Emma, Mary Margaret, David, Regina, M. Gold et Crochet entrent au Pays Imaginaire à la recherche d'Henry, ils sont accueillis par une école de sirènes peu amicales qui menacent de mettre un terme à leur recherche avant qu'elle ne commence. Henry se retrouve à fuir les Enfants Perdus avec un autre échappé du camp de Peter Pan. Neal, se remettant de ses blessures, voyage à travers la Forêt Enchantée avec Mulan pour tenter d'apprendre les destins d'Emma et Henry.

S3 E2 • L'Orpheline

Alors qu'Emma, Mary Margaret, David, Regina et Crochet continuent leur recherche d'Henry au Pays Imaginaire, Peter Pan apparaît devant une Emma surprise et lui offre une carte qui va révéler les allées et venues de son fils. Mais la seule façon de faire apparaître la carte pour Emma est de cesser de nier qui elle est vraiment et venir à bout de ses vrais sentiments au sujet de son identité - et M. Gold reçoit certains conseils inattendus d'un ami qui pourrait l'amener à comprendre le voyage de sa vie tout en étant au Pays Imaginaire. Pendant ce temps, sur les terres du conte de fée, quand la Reine du Mal présente à Blanche Neige une offre pour vivre sa vie en paix avec Charmant - avec la mise en garde qu'elle renonce à sa prétention au trône - Charmant décide de veiller à ce que Blanche n'accepte pas l'offre.

S3 E3 • La Fée Clochette

Dans leur quête continue pour trouver la cachette de Peter Pan et sauver Henry, Crochet suggère de traquer la Fée Clochette dans l'espoir qu'elle les mènera directement à son camp. Pan révèle à Henry pourquoi il l'a amené au Pays Imaginaire. Dans la forêt enchantée, Neal a un plan qui pourrait le transporter à Emma, mais ça impliquerait d'utiliser un des biens les plus précieux de Robin des Bois. Pendant ce temps, dans le pays des contes de fée, la Fée Clochette propose à Regina de l'aider à améliorer sa vie.

S3 E4 • Les Enfants perdus

Mr. Gold prend la décision d'affronter Pan, mais il est-ce qu'il va aller là bas pour sauver Henry ou céder à la prophétie que le garçon le mènera à sa perte? Neal se retrouve au Pays Imaginaire et sous la garde de l'un des plus fidèles des Enfants Perdus de Pan. David se bat pour sa vie tandis que le poison continue à faire sentir ses effets sur lui. Pendant ce temps, dans le conte de fées, Rumplestiltskin va à la recherche d'un Bae disparu, qui a suivi un personnage mystérieux qui vole des enfants avec sa musique.

S3 E5 • La naissance d'un pirate

Avec le poison mortel qui se répand à travers le corps de David qui se raproche de la mort, Crochet le conduit dans un dernier voyage pour trouver un sextant qui pourrait les aider à déchiffrer une carte qui pourrait les faire sortir du Pays Imaginaire. Pendant ce temps, dans les Contes de Fées, Killian Jones - aka Crochet - et son frère, le Capitaine Liam, naviguent au large sous les ordres du Roi pour trouver une plante indigène puissante sur ​​un terrain inexploré qui pourrait aider à guérir n'importe quelle blessure.

S3 E6 • Ariel

Dans les Contes de Fées, quand Ariel sauve Blanche Neige d'une noyade dans les profondeurs de l'océan, Blanche rend la pareille en aidant sa nouvelle amie à se familiariser avec le prince Eric, avec qui elle est tombée follement amoureuse. Pendant ce temps, Emma, Mary Margaret, David et Crochet tentent de sauver Neal, qui est emprisonné dans un des campements de Pan, et Regina et M. Gold font équipe à contrecœur pour trouver un moyen de faire chuter Pan.

S3 E7 • La Boîte de Pandore

Ariel est renvoyé à Storybrooke avec un objet qui aidera Belle à trouver un artefact caché. Crochet, Neal et Emma se sont mis à capturer l'ombre de Peter Pan. Mary Margaret est contrariée que David ait caché son empoisonnement.

S3 E8 • Pense à de jolies choses

Pan tente de convaincre Henry qu'il peut sauver la magie et le Pays Imaginaire. Dans le passé, un jeune Rumplestiltskin reçoit un objet magique qui pourrait lui donner un nouveau départ avec son père.

S3 E9 • Peter Pan n'échoue jamais

Alors que la vie d'Henry est dans la balance, la course est lancée pour empêcher Pan d'acquérir les pouvoirs magiques du cœur du vrai croyant. Pendant ce temps, à Storybrooke du passé, Regina décide de combler un vide dans sa vie et, avec l'aide de Mr Gold, vise à adopter un bébé.

S3 E10 • Le Nouveau Pays Imaginaire

Les habitants de Storybrooke sont fous de joie du retour de Henry et nos héros du Pays Imaginaire. Mais à leur insu, un plan est secrètement mis en place par un Pan bien caché qui va secouer jusqu'à la vie même des habitants de la ville. Pendant ce temps, dans les terres des Contes de Fées, le voyage de noces de Blanche-Neige et du Prince Charmant s'avère être tout sauf romantique quand ils vont à la recherche d'un être mystique qui pourrait arrêter la froideur de Regina.

S3 E11 • Garder espoir

La course s'accélère pour empêcher Pan de lancer une autre malédiction sur les habitants de Storybrooke qui pourrait tuer tous les êtres vivants de la ville.

S3 E12 • Un pirate dans la ville

A New York, Crochet tente de se faire rappeler à Emma qui elle est vraiment. Dans le passé, les résidents de Storybrooke retournent à la Forêt Enchantée et sont menacés par une menace à nulle autre pareille.

S3 E13 • Chasse aux sorcières

A New York, Crochet tente de faire resurgir en Emma quelque chose de très puissant : le véritable amour. Dans la Forêt Enchantée, Regina, Blanche, et toute l'équipe de Charmant se confrontent à une sorcière très puissante. Dans le passé d'un autre monde, une jeune fille apprend à utiliser la magie plutôt que d'être chassée par une foule.

S3 E14 • Le fantôme de la peur

Emma, David, Mary-Margaret, Regina et Crochet organisent la traque de la sorcière. David se fait attaquer par un être cagoulé qui semble invincible et qui a le même visage que lui. Dans la Forêt Enchantée, neuf mois avant la deuxième malédiction, Blanche-Neige annonce à James qu'elle est enceinte.

S3 E15 • Une vie pour une vie

Alors qu'Emma, David, Mary-Margaret, Belle, Crochet et Regina se décident à retrouver Rumplestiltskin qui s'est échappé de la maison de la sorcière de l'ouest, c'est Neal qui réapparaît à la porte du magasin de Gold, hagard et avec une étrange cicatrice dans la paume de la main. Dans le passé, Neal et Belle fouillent les livres de la bibliothèque de Rumplestiltskin afin de trouver un moyen de le ramener à la vie. C'est un homme, Lumière, emprisonné dans un chandelier qui leur indique un livre où se trouve la clé du caveau du Ténébreux.

S3 E16 • Verte de jalousie

Zelena démasquée, les Charmants et Regina cherchent à comprendre ses intentions après avoir enterré Neal. La Sorcière de l'Ouest surgit, révèle sa parenté à Regina et lui lance un défi : un duel de sorcières dans la rue principale à la tombée de la nuit. Dans le monde des comptes de Fées, Zelena a été amenée à Oz par une tornade et recueillie par un bûcheron et sa femme. Bébé, elle montrait déjà une grande maîtrise de la magie, ce qui a toujours terrifié son père adoptif.

S3 E17 • Baiser mortel

Préparant la prochaine offensive de Zelena, Emma prend la décision de s'entraîner à contrôler la magie avec Regina. David et Mary-Margaret approuvent sa décision et promettent de prendre soin d'Henry, mais Emma pensait le confier plutôt à Crochet. Dans la Forêt enchantée, Crochet recherche celui qui lui a dérobé le Jolly Roger et vit une vie de bandit de grand chemin avec Mouche. Un soir alors qu'il n'est pas de cœur à célébrer son dernier coup, il est attaqué par Ariel, qui l'accuse d'avoir kidnappé son prince.

S3 E18 • À travers le sang

Un matin, Zelena apparaît dans la demeure de Regina, apparemment pour discuter du passé et du lien qui les unit. Regina n'est pas dupe et comprend qu'il se trame quelque chose : en effet, Zelena est venue retenir Regina pendant que Rumplestiltskin est parti vers le groupe de Robin des Bois et dérober le cœur de la Méchante Reine, n'hésitant pas à menacer le fils de Robin pour l'obtenir. Dans sa jeunesse, Cora travaillait comme serveuse dans une taverne, sa beauté attirant l’œil de nombreux clients. Un jour, un homme se présentant comme un prince lui demande sa main ; elle accepte et passe la nuit avec lui.

S3 E19 • Un cœur pour deux

Emma, Mary-Margaret, David et Regina, qui essaie de garder secrète sa romance nouvelle avec Robin des Bois, essaient de trouver le moyen de briser la malédiction en tentant de reprendre point par point comment ils y sont parvenus la première fois. Seul une chose a changé et elle peut s'avérer déterminante : Henry ne croit plus en la magie et la réalité des contes. Dans le monde des comptes de Fées, Belle rejoint Blanche-Neige dans le palais de Regina et lui révèle le sort de Rumplestiltskin et Baelfire. Aurore révèle que Zelena l'a menacé de se taire à son propos et de ses plans : elle a besoin du bébé de la princesse.

S3 E20 • Nous ne sommes plus au Kansas

Tous se précipitent à l'hôpital : Mary-Margaret est en train d'accoucher. Emma et Regina prennent toutes les mesures nécessaires pour empêcher Zelena de prendre l'enfant, mais par prudence, David demande à Emma et Crochet d'aller retenir la sorcière chez elle. En Oz, Zelena est approchée par Glinda, qui sait les désirs de vengeance de la Sorcière de l'Ouest et veut lui proposer une alternative : rejoindre la sororité des sorcières d'Oz, où elle pourra siéger et faire le bien avec ses égales du Nord, de l'Est et du Sud.

S3 E21 • L'Effet papillon

À Storybrooke, tous se réjouissent de la fin du règne de terreur de Zelena sauf Emma qui a du mal à cacher son souhait de retourner à New-York. Alors que tous se réunissent pour une cérémonie informelle pour annoncer le nom de l'enfant de Mary-Margaret et David, Emma s'éloigne. Emma et Crochet font aspirer par un portail et se retrouvent dans la Forêt Enchantée, alors que Regina est encore la Méchante Reine et Blanche-Neige une fugitive. Ils décident d'aller voir la seule personne susceptible de pouvoir les renvoyer dans le futur, Rumplestiltskin, mais doivent tout faire pour éviter de changer le passé.

S3 E22 • On n'est jamais aussi bien que chez soi

Emma est mise au cachot de la Reine, où elle retrouve une femme qu'elle avait vue captive de la reine et menacée de mort pour terroriser les habitants. Dans la forêt, Blanche-Neige est capturée par Charmant, mais elle n'a pas la bague qu'il cherche et c'est Crochet qui les informe qu'Emma l'a en sa possession.