S3 E1 • Basics (2)

Stardate: 50023.4 Le Voyager est capturé par les Kazon et l'équipage est débarqué sur une planète dans ses premiers stades de son évolution. Étant donné que seul Tom Paris et Lon Suder ont échappé à la capture, c'est à eux et l'EMH de venir avec un plan pour reprendre le vaisseau.

Première diffusion : 4 septembre 1996

S3 E2 • Flashback

Stardate: 50126.4 Après être tombé malade par ce qui semble être un souvenir refoulé, Tuvok doit effectuer une fusion d'esprit avec le capitaine Janeway afin de survivre. La fusion les ramène quand Tuvok était un agent de science junior à bord de l'USS Excelsior sous le commandement du capitaine Hikaru Sulu.

Première diffusion : 11 septembre 1996

S3 E3 • The Chute

Stardate: 50156.2 Paris et Kim sont envoyés dans une prison Akritian après avoir été accusé d'un attentat terroriste.

Première diffusion : 18 septembre 1996

S3 E4 • The Swarm

Stardate: 50252.3 Le Voyager explore une région de l'espace appartenant à une race mystérieuse d'aliens, qui prendrait 15 mois pour en faire le tour. Lors du franchissement des frontières, un essaim de navires s'attachent d'eux-mêmes à la coque du Voyager - un acte qui draine les réserves énergétiques du navire et menace de le détruire.

Première diffusion : 25 septembre 1996

S3 E5 • False Profits

Stardate: 50074.3 Deux "Ferengis" se font passer pour des dieux au yeux d'une culture encore à L'âge du Bronze. Il est découvert qu'ils étaient arrivés à travers le trou de ver de Barzan, qui ramène au Quadrant Alpha, cependant, sa fin dans le Quadrant Delta est très instable et toujours en mouvement.

Première diffusion : 2 octobre 1996

S3 E6 • Remember

Stardate: 50203.1 Après que Voyager rencontre une race de télépathe, B'Elanna commence à avoir des rêves puissants qui dépeignent la vie d'une femme et son amant dans un moment de grand bouleversement politique et social.

Première diffusion : 9 octobre 1996

S3 E7 • Sacred Ground

Stardate: 50063.2 Le capitaine Janeway doit se soumettre à un rituel rigoureux afin de sauver la vie de Kes , alors que celle-ci est assommé.

Première diffusion : 30 octobre 1996

S3 E8 • Future's End (1)

Stardate: Inconnu Le Voyager et un vaisseau temporel de la fédération du 29e siècle, le Aeon remonte dans le temps de la Terre jusqu'à la fin du 20e siècle. Le vaisseau temporel Aeon a un accident en Arizona dans les années 1960, tandis que le Voyager apparaît en orbite autour de la Terre en 1996.

Première diffusion : 6 novembre 1996

S3 E9 • Future's End (2)

Stardate: 50312.5 Tout en essayant de sauver Paris et Tuvok, Torres et Chakotay sont capturés par un gang de trafiquants d'armes qui croient qu'ils sont du gouvernement.

Première diffusion : 13 novembre 1996

S3 E10 • Warlord

Stardate: 50348.1 Un étranger lésé nommé Tieran transfère sa conscience dans l'esprit de Kes un moment avant qu'il ne meurt. Il a alors le contrôle sur elle et commence à utiliser ses capacités pour voler une navette et retourner dans son monde d'origine pour tenter un coup politique.

Première diffusion : 20 novembre 1996

S3 E11 • The Q and the Grey

Stardate: 50384.2 Voyager rencontre plusieurs supernova dans une petite région de l'espace. Time révèle bientôt que celles-ci sont les séquelles d'une guerre civile au sein du Q-Continuum. Q apparaît et croit que la solution au problème est pour lui de "produire" un enfant et sa compagne de choix est le capitaine Kathryn Janeway. Les choses sont compliquées quand une femelle jalouse Q apparaît affirmant que Q était son petit ami.

Première diffusion : 27 novembre 1996

S3 E12 • Macrocosm

Stardate: 50425.1 Neelix et Janeway au retour d'une mission trouve le Voyager à la dérive dans l'espace et l'équipage à peine vivant. Ils apprennent bientôt que le vaisseau a été envahie par des formes de vie virale qui se développent rapidement en taille.

Première diffusion : 11 décembre 1996

S3 E13 • Fair Trade

Stardate: Inconnu Le Voyager rencontre une région de l'espace nommé le "Nekrit Expanse". Neelix n'a plus de connaissances sur l'espace après ce point, il cherche à se faire sentir utile à l'équipe en essayant d'obtenir une carte d'un vieil ami nommé Wixiban, qui l'utilise comme un courrier pour les substances illicites.

Première diffusion : 8 janvier 1997

S3 E14 • Alter Ego

Stardate: 50460.3 L'enseigne Kim demande à Tuvok de lui enseigner les techniques de contrôle émotionnel vulcain quand il tombe en amour avec un personnage du holodeck nommé Marayna. Kim devient vite jaloux quand il voit Tuvok interagir avec elle derrière son dos, alors qu'elle tente de le séduire.

Première diffusion : 15 janvier 1997

S3 E15 • Coda

Stardate: 50518.6 Le capitaine Janeway meurt à plusieurs reprises après qu'elle et Chakotay s'écrasernt sur une planète dans ce qui semble être une boucle temporelle. Bientôt, son père défunt apparaît et lui dit qu'elle est morte et doit accepter sa situation affin de progresser.

Première diffusion : 29 janvier 1997

S3 E16 • Blood Fever

Stardate: 50537.2 Ensign Vorik exprime son désir de s'accoupler avec B'Elanna lors de son Pon-Farr. Après qu'ils l'obtiennent dans une bagarre, Torres commence à montrer aussi des signes de Pon Farr.

Première diffusion : 5 février 1997

S3 E17 • Unity

Stardate: 50614.2 Au cours d'une mission, Chakotay découvre une signature de la Fédération provenant d'une planète étrangère. Après l'atterrissage, il apprend que tout n'est pas aussi paisible et ceux qui l'aident n'ont pas été tout à fait honnête envers lui au sujet de leur véritable origine.

Première diffusion : 12 février 1997

S3 E18 • Darkling

Stardate: 50693.2 Lorsque le médecin tente d'améliorer sa personnalité, en intégrant les profils psychologiques de personnages célèbres et historiques, il est accablé par leur côté sombre et commence à donner des signes d'une double personnalité, d'un côté un médecin normal et de l'autre noir et diabolique. Kes demande à quitter Voyager quand ils rencontrent une race avec une vaste connaissance de la région de l'espace qu'ils explorent actuellement.

Première diffusion : 19 février 1997

S3 E19 • Rise

Stardate: Inconnu Neelix est poussé à ses limites lorsque l'attitude de Tuvok devient trop lourd à porter alors qu'ils sont en mission pour aider à évacuer la planète "Nezu", qui est bombardé d'astéroïdes.

Première diffusion : 26 février 1997

S3 E20 • Favorite Son

Stardate: 50732.4 Harry Kim expérimente une forte sensation de déjà vu dans une région inconnue de l'espace. Il apprend bientôt qu'il est originaire de cette région et qu'il est "T'Karian", et non humain.

Première diffusion : 19 mars 1997

S3 E21 • Before and After

Stardate: 50973 Kes commence à voyager en arrière dans le temps à partir du moment de sa mort. À chaque quart de travail, elle se rapproche de la solution.

Première diffusion : 9 avril 1997

S3 E22 • Real Life

Stardate: 50863.2 Le médecin décide qu'il doit créer une famille holographique afin de se développer. B'Elanna est dégoûté par son perfectionnisme irréaliste, elle modifiera le programme pour inclure des événements aléatoires et les résultats étant intéressants et dévastatrice.

Première diffusion : 23 avril 1997

S3 E23 • Distant Origin

Stardate: Inconnu Un paléontologue aliens découvre un lien commun ancestral entre son peuple et les humains. Il estime que cela prouve que son peuple (les Voth) a évolué sur Terre et migré vers le Quadrant Delta des millions d'années auparavant, mais son gouvernement n'est pas disposé à croire son interprétation de la preuve.

Première diffusion : 30 avril 1997

S3 E24 • Displaced

Stardate: 50912.4 Les membres d'équipage sont remplacés un par un avec des aliens à partir d'une race inconnue.

Première diffusion : 7 mai 1997

S3 E25 • Worst Case Scenario

Stardate: 50953.4 B'Elanna Torres découvre un programme holodeck où Chakotay et les rebelles du maquis contre Janeway.

Première diffusion : 14 mai 1997

S3 E26 • Scorpion (1)

Stardate: 50984.3 Voyager entre enfin dans l'espace Borg, pour découvrir une menace plus puissante que les Borgs eux-mêmes.

Première diffusion : 21 mai 1997