S2 E1 • Le mal Napolitain

Dans le premier épisode de la saison 2, le pape Alexandre VI prend une nouvelle maîtresse et organise une grande fête païenne pour les citoyens de Rome. Une cache d'objets antiques est découverte. La rivalité entre les frères Cesare et Juan se dévoile dans les rues. Lucrezia donne naissance à son nouveau-né. Della Rovere, un prête pastorale, échappe de justesse à une tentative d'assassinat.

S2 E2 • Narcisse

Le garçon d'écurie qui est le père de l´enfant de Lucrezia se dirige vers Rome pour un rendez-vous avec elle, mais connaît un destin malheureux alors qu´il tombe entre les mains de Juan. Les concubines du pape, Giulia et Vittoria, l´entraînent sous un déguisement pour une tournée révélatrice des indigents de Rome.

S2 E3 • Fragile illusion

Alexandre VI refuse de permettre un enterrement catholique pour Paolo, en dépit de ses doutes au sujet du suicide du garçon d'écurie. Lucrezia entame une grève de la faim, ce qui menace la vie de son fils en bas âge. L'armée française se dirige de nouveau à Rome, allié avec Sforza. Della Rovere revient dans la ville pour lancer un complot contre la vie du Pape.

S2 E4 • Guerre secrète

Cesare recrute une bande de mercenaires avec l'aide de Micheletto et cherche à se venger des troupes françaises en retraite pour avoir brûlé le couvent où sa bien-aimée Ursula vivait. Le pape crée des alliances stratégiques et s´enrichit du même coup. Lucrezia rejoint la quête de Giulia afin d´aider les pauvres de Rome.

S2 E5 • L'ultimatum

Le pape dépêche Cesare au château de Catherina Sforza pour exiger son allégeance, et traite avec les rusés Sforza de façon décisive. Alexandre se déguise et se rend à Florence pour entendre le prédicateur fougueux Savonarole, ne réalisant pas que Della Rovere tente de recruter le saint homme rebelle à sa cause.

S2 E6 • Tu es poussière

Convaincu que la foudre destructrice sur la basilique Saint-Pierre lors d'une messe était un signe de la désapprobation de Dieu, Alexandre commence un jeûne du carême. Cesare tente de prouver sa valeur en tant que commandant militaire avec un raid en vue de voler l´or de Médicis. Le pape exerce de la pression auprès de Lucrezia afin qu´elle accepte encore un autre mariage politiquement avantageux.

S2 E7 • Le Siège de Forli

Impressionné par le retour triomphal de Juan d'Espagne avec le général Don Hernando à son côté, Alexandre envoie son fils assiéger le château de Catherina Sforza, mais une tournure surprenante des événements révèle la lâcheté de Juan. Lucrezia saborde volontairement un stratagème pour la marier à un riche marchand de Genovese. Les forces de Savonarole conduisent vers le fameux « le Bûcher des Vanités ».

S2 E8 • Vérité et Mensonges

Juan, amer et humilié de la défaite de son armée à Forli, est en train de mourir de la syphilis et d’une plaie qui s’est infectée. Lucrezia tergiverse sur le mariage avec Calvino tout en flirtant avec son frère. Le plan d'assassinat de Della Rovere est confronté à un dernier obstacle: comment remplacer son goûteur?

S2 E9 • Juge et Juré

C'est Pâques, mais Alexandre continue à jeûner. Un nouveau goûteur est recruté, et Antonello obtient le poste. L’assassin de Della Rovere est prêt à frapper…

S2 E10 • La Confession

Cesare fait de faux aveux et Savonarole est brûlé comme hérétique. Lucrezia tombe amoureuse et annonce qu'elle va se marier. Lors de ses fiançailles, Cesare se rend compte trop tard du danger que court le pape lorsqu'il pose se lèvres sur une coupe empoisonnée....