S4 E1 • Au service de sa Majesté (1)

Booth accompagne Brennan en Angleterre, où elle doit donner une conférence dans la prestigieuse université d'Oxford. Mais le meurtre d'une héritière américaine va les amener à collaborer avec les autorités locales...

S4 E2 • Au service de sa Majesté (2)

Leurs conférences passées, et l'affaire de l'homicide de l'héritière américaine résolue, Booth et Brennan s'apprêtent à repartir. Mais, Cate Pritchard, l'une de leur homologue leur fait part de la disparition mystérieuse de son équipier, Ian Wexler...

S4 E3 • Les hommes de sa vie

Le corps du présentateur d'un reality-show est retrouvé dans les toilettes préfabriquées d'un chantier. Le premier suspect est un des maris infidèle...

S4 E4 • Un après-midi de chien

Lorsque Parker découvre un doigt dans un nid, Booth et Brennan enquêtent sur la mort de la victime à laquelle il appartenait. Cela les conduit dans l'univers souterrain des combats de chien.

S4 E5 • T.O.C

Des morceaux de corps sont découverts dans une bassin d'évaporation, seule la tête manque à l'appel. Booth et Brennan commencent leur enquête mais cet élément clé leur fait cruellement défaut.

S4 E6 • La reine des abeilles

Lorsque l'ascenseur d'un immeuble s'arrête brusquement, une jambe décomposée tombe par un panneau du plafond. Booth et Brennan doivent trouver le coupable d'autant plus que celui-ci semble fumer des joints...

S4 E7 • Elle et lui

Deux hippies trouvent une moitié de corps dans la mer. Booth et Brennan enquêtent sur le meurtre mais l'affaire devient très étrange lorsqu'ils découvrent que la victime possède à la fois les caractéristiques d'un homme et d'une femme.

S4 E8 • Art en scène

Booth et Brennan suspectent l'assistante d'un artiste dépressif d'être l'auteure du meurtre de son mentor, maquillé en suicide. Durant l'interrogatoire, celle-ci révèle être lesbienne et heureuse de revoir Angela, son premier amour...

S4 E9 • Mon frère

Alors qu'un ranger fait une démonstration à des cadets leur apprenant pourquoi il ne faut pas lancement de grenade lacrymogène dans un laboratoire de meth, l'explosion qui en résulte propulse un corps qui n'aurait pas dû s'y trouver...

S4 E10 • Le passager 3-B

Booth et Brennan s'envolent pour la Chine aider le gouvernement à identifier des ossements anciens. Mais en cours de vol, un homicide a été commis. Une fois la liaison établie avec l'Institut Jefferson, les coéquipiers enquêtent avec les moyens du bord et doivent résoudre ce crime avant l'atterrissage de l'avion et la perte de leur juridiction...

S4 E11 • La bonne éducation

Max, le père de Brenna, obtient un poste de professeur au Jeffersonian. Quand il se retrouve à aider à la résolution d'une enquête sur un meurtre, Brennan est gênée de la soudaine présence de son père dans sa vie professionnelle.

S4 E12 • Quel cirque !

Booth et Brennan enquêtent dans le monde du cirque, sur la mort de deux soeurs siamoises. Pour les besoins de l'enquête, Seeley montre ses talents de lanceur de couteaux...

S4 E13 • Le feu sous la glace

Quand un pompier bénévole est retrouvé mort, Booth fait partie des suspects car quelques jours auparavant, il s'est disputé avec lui à la patinoire lors d'un match de hockey sur glace. L'agent Payton Perotta est alors envoyée par le FBI pour superviser l'enquête.

S4 E14 • La chute des héros

Booth est kidnappé par le Fossoyeur et l'équipe du Jeffersonian doit le trouver et le sauver avant qu'il ne soit trop tard. En attendant, quand une preuve vient à manquer dans l'affaire du Fossoyeur, Brennan et Hodgins sont suspectés de l'avoir prise.

Première diffusion : 5 février 2009

S4 E15 • Le chevalier noir

Alors que Booth est hors course à cause de ses problèmes de dos, Brennan fait de nouveau équipe avec l'agent Perotta. L'enquête les mène à une convention de science fiction pour élucider le meurtre d'une jeune femme.

S4 E16 • Une affaire de famille

Lors de leur cérémonie de mariage en saut en élastique, un couple découvre un corps. L'enquête mène Brennan et Booth dans un magasin de voitures. Pendant ce temps, l'équipe du Dr Brennan doit se dépêcher de trouver les preuves car le corps se décompose très rapidement en mousse verte.

Première diffusion : 12 mars 2009

S4 E17 • La femme de Loth

Une équipe d'entretien des routes a découvert le corps d'une lycéenne dans leur camion. Pendant l'enquête, Brennan et Booth découvre que plusieurs lycéennes enceintes ont créé un groupe pour élever leurs enfants ensemble. Pendant ce temps, l'équipe du Dr Brennan est surprise par l'arrivée d'un nouveau stagiaire et Roxie rompt avec Angela.

S4 E18 • Retour vers le passé

Le corps à moitié mangé de l'ex fiancé de Cam est trouvé dans la cage du tigre d'un zoo. Booth et Brennan déterminent que sa mort n'est pas accidentelle. L'équipe reconstitue la dernière soirée de la victime et interroge les suspects.

Première diffusion : 2 avril 2009

S4 E19 • Publier ou périr

Booth et Brennan sont sur une affaire d'os humains pulvérisés retrouvés dans un sac poubelle sur les lieux d'une séance photos. Quand l'équipe découvre un morceau de météorite logé dans l'oreille de la victime, cela les mène au Collar Institute of Science, un prestigieux centre de recherche à Washington. Après avoir interrogé les scientifiques de l'institut, ils découvrent que les restes appartiennent au Dr. Diane Sidman, une grande scientifique aussi rédactrice en ched du Journal du Collar Institute, également fiancée au fondateur du Collar Institute. Quand ils découvrent que le Dr. Sidman travaillait sur un projet extrêmement controversé, Brennan et Booth enquêtent sur de multiples menaces de mort dirigées contre elle.

S4 E20 • L'amour a ses raisons

Booth et Brennan enquêtent sur le meurtre d'une future mariée dont le corps a été retrouvé compacté dans une usine de recyclage. Au cours de l'investigation, ils croisent la fiancée du docteur Sweets, en plein essayage de robe de mariée et en compagnie d'un autre homme...

Première diffusion : 15 avril 2009

S4 E21 • L'aigle de sang

Un squelette humain est utilisé comme accessoire de scène par un groupe de death metal norvégien, que les autorités identifient comme un citoyen américain. L'équipe traque les restes jusqu'à un groupe de death metal underground américain et identifie la victime comme le bassiste nommé Mayhem d'un groupe appelé Spew.

Première diffusion : 16 avril 2009

S4 E22 • Qui a tué ce cher Hank ?

Toute l'équipe se rend à l'enterrement d'un employé du Jeffersonian de la section Égyptologie. Mais en observant le corps, Brennan est persuadé que la mort n'est pas accidentelle et arrive à convaincre Booth de l'aider à voler le corps pour qu'elle et Cam puissent l'étudier.

S4 E23 • La vérité masquée

Un ami détective de Booth, Ken Nakamura, l'appelle de Tokyo paniqué quand sa sœur Sachi disparaît à Washington. Booth et Brennan sont sur le coup, et leur enquête les mène à un canal où ils trouvent la tête de Sachi. Leur enquête va les conduire dans le milieux de la prostitution.

S4 E24 • Émancipation

Quand le corps d'un jeune appartenant à une fraternité, surnommé Beaver, est trouvé à l'intérieur de l'uniforme de le mascotte d'une école rivale, Brennan et Booth découvrent qu'il préparait une tuerie.

S4 E25 • Baby blues

Booth et toute l'équipe s'immergent dans le monde subtil de l'oenologie pour tenter de résoudre le meurtre d'un éminent critique. Parallèlement à cette enquête, Brennan prend la décision de concevoir un enfant ; elle ne cache pas à Booth qu'elle a pensé à lui pour en assurer la paternité biologique...

S4 E26 • De l’électricité dans l’air

Toujours plongé dans le coma, le subconscient de Booth lui fait entrevoir la vie dont il rêvait dans les bras de Brennan.