S3 E1 • Basses Vengeances

Après sa rencontre avec John le rouge, Jane commence à se demander s'il appartient vraiment à l'équipe. Pendant ce temps, un éminent avocat est kidnappé et la directrice du CBI veut Jane sur cette affaire.

Première diffusion : 23 septembre 2010

S3 E2 • Belle Famille

Jane doit aider son ancien beau-frère qui s'est attiré des problèmes dès son arrivée en ville en se retrouvant mêlé à une affaire de meurtre.

S3 E3 • Où es-tu Kristina ?

Lorsque Patrick Jane se retrouve à nouveau face au chef de secte Bret Stiles, Stiles lui offre des informations concernant John le rouge et Kristina Frye qui est disparue.

S3 E4 • Carte blanche

Un ancien détenu qui venait d'être libéré grâce aux analyses ADN est tué. L'équipe du CBI est appelée afin de résoudre cette affaire.

S3 E5 • Pur sang

Patrick Jane et l'équipe du CBI enquêtent sur la mort d'un jockey récemment revenu à la compétition.

S3 E6 • Propriété très privée

Un meurtre et une personne disparue au sein de la demeure ultra-sécurisée d'une riche famille laissent Jane et l'équipe du CBI perplexes.

S3 E7 • Aventure sans lendemain

Jane et l'équipe du CBI échappent de peu à la mort lorsqu'un bâtiment explose alors qu'ils sont en train d'y enquêter au sujet d'une menace de mort. Pendant ce temps, il y a des étincelles entre Lisbon et Walter Mashburn qui est mêlé à l'affaire.

S3 E8 • Jane en danger

Afin de retrouver Patrick Jane qui a été kidnappé, Lisbon et son équipe analysent les dossiers des différentes enquêtes auxquelles Jane a participé afin de trouver des suspects. Ils réalisent alors que pratiquement tout le monde a des raisons de lui en vouloir.

S3 E9 • Au clair de lune

Patrick Jane accepte l'aide d'un astrologue local, Ellis Mars, pour résoudre le puzzle d'un tripe homicide qui implique deux policiers et la fiancée d'un ouvrier d'EMT.

S3 E10 • Noël au balcon

Le CBI suit deux pistes lorsqu'un Père Noël est assassiné : Patrick Jane intègre, sous couverture, un groupe d'alcooliques anonymes auquel la victime appartenait tandis que Rigsby et Van Pelt interrogent les membres d'une société de Père Noël. Pendant ce temps, J.J. LaRoche interroge les différents membres du CBI afin de découvrir qui a tué le criminel qui a été brûlé dans sa cellule.

S3 E11 • Envoyée au tapis

L'équipe enquête sur le meurtre d'une jeune femme liée au milieu de la lutte professionnelle. Pendant ce temps, LaRoche s'intéresse maintenant à Rigsby pour son enquête.

S3 E12 • L’homme des cavernes

Lorsque Patrick Jane et le CBI doivent travailler avec un profiler, le docteur Montague, pour résoudre un double homicide, cela devient une compétition pour Jane afin de prouver que ses méthodes sont meilleures.

S3 E13 • Plus rien à perdre

Un homme armé prend en otage un groupe de personne, dont Patrick Jane. Cet homme armé, qui est le suspect numéro 1 dans une affaire de meurtre, clame son innocence, mais personne ne le croit.

S3 E14 • Sang pour sang

L'équipe enquête sur la mort d'un témoin que Van Pelt avait à sa charge. Entre temps, LaRoche continue son enquête sur la mort de Todd Johnson et Van Pelt est visée, il lui propose un marché. Craig O'laughing (l'amoureux de Grace) la demande en mariage.

S3 E15 • La Ruée vers l'or

Au moment où l'équipe s'apprête à enquêter sur la mort d'un prospecteur d'or, Teresa se blesse à la cheville. Elle doit rester au bureau. L'agente Hightower prend donc la place de Lisbon. Madeleine Hightower doit composer avec ses problèmes personnels, quand ses enfants débarquent au CBI.

S3 E16 • Liaison dangereuse

LaRoche poursuit son enquête sur la mort de Todd Johnson. Cinq suspects sont dans sa ligne de mire. La première suspecte à subir un interrogatoire est Madeleine Hightower. Entre temps, l'équipe enquête sur le meurtre d'un dealer dont le corps a été retrouvé dans un musée. Un lien est vite fait entre le meurtre du dealer et Todd Johnson. Bien vite, les soupçons de LaRoche envers un suspect se concrétisent.

S3 E17 • Du sang sur le green

Un médecin est retrouvé mort sur un court de golf. L'équipe pense que le tueur est à l’hôpital. LaRoche prend le contrôle du CBI et nomme Cho chef d'équipe.

S3 E18 • Enquête assistée

Un homme est retrouvé mort dans un champs. Le docteur Steiner est appelé pour examiner le corps. Patrick agace le docteur Steiner au grand désarroi de Teresa. Peu de temps après être parti, le docteur Steiner se fait voler le corps. Au cours de l'enquête, l'équipe découvre que l'homme avait déjà été kidannapé par des ovnis par le passé et ceux-ci ont fait des expériences sur lui. Patrick n'en croit pas un mot. Pendant que Grace se prend un temps pour chercher sa robe de mariée dans une boutique. Wayne est bouleversé en la voyant habillée ainsi. Pendant ce temps, le docteur Steiner fait une lourde révélation à Patrick.

S3 E19 • La Veuve joyeuse

L'équipe enquête sur la mort de John Flynn, le propriétaire (avec sa femme Erika) de l'agence de rencontre Symphonie. Plusieurs suspects sont sous surveillance du CBI : les clients de l'agence et les proches de John Flynn. Pendant que le reste de l'équipe enquête sur les autres suspects, Patrick soupçonne la femme du propriètaire d'avoir tuer son mari. Celle-ci nie, car au moment du meurtre, elle était avec une cliente dans le studio d'enregistrement. Au cours de l'enquête, Wayne fait la connaissance de Sarah, une cliente de l'agence Symphonie.

S3 E20 • Tapis rouge

Quand un espion du secteur privé est retrouvé mort dans un atelier de réparation d'appareil électronique, Jane et le CBI doivent éclaircir un mystère qui remonte à un accord dans le désert irakien. Pendant ce temps, Jane embauche un cambrioleur afin de voler dans la maison LaRoche, sa liste de suspects dans l'affaire Todd Johnson. Lorsque le cambrioleur se fait prendre, Patrick n'a que 24 h pour tenter de se revaloir et pour sauver le cambrioleur. Patrick révèle à Teresa qu'un ami de John le Rouge a infiltré le CBI et soupçonne LaRoche d'être cette personne.

S3 E21 • Père et Flic

L'équipe enquête sur le meurtre d'un gardien de prison, Walton Untill, qui étudiait pour devenir détective. Alors que l'équipe n'avait plus de pistes pour relancer l'enquête, Wayne propose d'aller interroger son père, Steven Robert Rigsby, un criminel endurci, afin de relancer l'enquête. Grace distribue ses invitations pour son mariage. Wayne donne sa réponse à Grace, quant à sa présence au mariage de celle-ci.

S3 E22 • Juste un pétale

L'équipe enquête sur une violoniste qui a été assassinée à un arrêt d'autobus. Alors que les autres membres de l'équipe enquête sur les proches de la violoniste, Patrick questionne et enquête du côté de l'Orchestre symphonique de Californie, dont la victime faisait partie. Cho est victime d'un jeune pickpocket.

S3 E23 • Les masques tombent (1re partie)

L'équipe enquête sur la mort de Allan Declun, un employé d'une entreprise de prêt d'argent, qui s'est fait explosé dans une station service. Teresa se fait prendre en otage par le poseur de bombe. Patrick est subjugué par la robe que Teresa portera au mariage de Grace.

S3 E24 • Les masques tombent (2e partie)

Suite à la mort de Max James, un client de Allan Declun et de l'entreprise de prêt d'argent, Madeleine Hightower reprend contact avec Patrick afin de se faire disculper du meurtre de Todd Johnson. Patrick réussit à obtenir les quatre autres suspects de la liste de J.J. LaRoche en échange de Madeleine Hightower. Ces 4 suspects sont Brenda Shettrick, relation public du CBI, Gael Burtroom, directeur CBI, Ouvalee Ardelow, D.A du CBI et Craig Olaughling mais Patrick suspecte toujours J.J. LaRoche d'être le contact et l'ami de John le Rouge. Néanmoins, lors de l'enquête, Teresa, Grace et Madeleine tuent le complice de John le Rouge. C'est suite à cela que Patrick décide de rentrer en contact visuel avec un individu se disant être John le Rouge et inflige à cet individu le traitement qu'il réservait à John le Rouge…