S14 E1 • Une nouvelle ère

L'équipe du NCIS s'intéresse à l'explosion d'une voiture à Washington. Le nom de l'agent spécial Nick Torres refait surface au cours de l'enquête, alors que ce dernier avait disparu six mois plus tôt lors d'une mission d'infiltration en Argentine.

S14 E2 • Les mauvais garçons

Le fils d'un Marine est empoisonné peu après avoir installé une bombe lors de retrouvailles entres anciens lycéens. L'équipe enquête alors sur un rèseau de voleur millionnaire.

S14 E3 • Pour quelques pièces d'or

Une sergente des marines se jette en bas de sept étages, alors que cette mort qui ressemble à un suicide, son psychologue, Grace Confalone conseille plutôt à Gibbs d'enquêter sur un meurtre.

S14 E4 • La croisière tigre

Lors de la mort d'une navigatrice de la Navy sur un navire de la Marine durant une croisière où les familles des marines peuvent séjourner deux jours sur le navire, Quinn, Gibbs et Palmer vont enquêter sur le bateau tandis que Torres, McGee et Bishop reste au quartier du NCIS. Durant l'enquête, McGee cherche le bon moment pour demander Delilah en mariage.

S14 E5 • Philadelphie

Gibbs envoie Bishop et Quinn à Philadelphie afin qu'elle parle à l'officier du MI-6 Clayton Reeves lorsque la disparition d'un agent du MI-6 est lié à la mort d'un quartier-maître. Quinn raconte à Gibbs l'enquête qui l'a poussé à quitté le terrain pour devenir instructrice.

S14 E6 • Les poupées russes

L'équipe enquête sur l'enlèvement d'une quartier-maître de la Navy et sur la disparition de son mari. Torres tente de s'excuse auprès Abby.

S14 E7 • La patrie des braves

Torres boldly breaks protocol when he learns a witness in an NCIS case is wanted by U.S. Immigration and Customs Enforcement. Also, Abby, Bishop and McGee woo landlord Tony DiNozzo Sr. in the hope of subletting Tony’s apartment.

S14 E8 • L'homme de Guantanamo

Après que l'agent Bishop ait été envoyée à Gitmo pour recueillir des preuves sur le meurtre d'un aumônier de la Navy, elle remet en question son ancien travail à la NSA. Pendant ce temps, les frères de Bishop, John et Robert, lui rendent visite lors des fêtes de Thanksgiving et harcèlent ses coéquipiers pour savoir avec qui elle sort.

S14 E9 • Une femme de cran

L'équipe du NCIS enquête sur une menace grandissante envers la Député du Congrès Jenna Flemming alors que le Directeur Vance supervise les détails de la protection temporaire.

S14 E10 • L'arnaqueur

Pendant que le NCIS tente de découvrir le lien entre le meurtre d'un capitaine de la Navy et la mère défunte de Ducky, le médecin légiste se rémémore un choix décisif qu'il a pris 37 ans auparavant. La nouvelle équipe du NCIS s'échange des confidences et des cadeaux de Noël et Gibbs passe le réveillon avec l'agent Fornell.

S14 E11 • Opération Willoughby

De nouvelles informations sur un terroriste remettent à jour l'opération Willoughby dans laquelle l'agent Clayton Reeves est infiltré. L'agent de la NSA et le petit ami de Ellie Bishop, Qasim Nassir, aide l'équipe du NCIS dans cette traque.

S14 E12 • Infiltration

Gibbs reprend une vieille affaire qu'il avait plus jeune où il était infiltré dans un petit réseau terroriste prévoyant vendre des bombes nucléaires.

S14 E13 • Dos au mur

Un jeune homme voit son père, un capitaine de la Marine, mourir renversé par une voiture. Jimmy Palmer sur place avec l'équipe va l’empêcher de se suicider du haut d’un immeuble. Leurs conversations au bord du précipice sont sujet à plusieurs flashbacks sur la vie de Palmer.

S14 E14 • Double vie

Le meurtre d'un sous-officier dans une petite ville en dehors de D.C. invite le NCIS à travailler une nouvelle fois avec "Les Sherlocks", une équipe d'enquêteurs indépendants qui ont inclus le nouveau membre : Anthony DiNozzo Sr.

S14 E15 • La boîte de Pandore (1)

Après que le groupe de réflexion sur la sécurité intérieure d'Abby soit compromis et qu'elle se retrouve avec une vraie bombe, l'équipe du NCIS découvre que le chef d'un groupe a été assassiné et qu'un livre théorique sur la terreur a été volé.

S14 E16 • Le choix d'Ellie

Bishop est plus déterminée que jamais pour venger le meurtre de Qasim, son dernier petit-ami, après que Gibbs et son équipe trouvent une nouvelle piste dans l'affaire sur Chen. Pendant ce temps, Torres apprend aux agents l'art de la dérobe, pratiquée par les pickpockets.

S14 E17 • La chambre des secrets

McGee découvre que son appartement a été retourné par un voleur essayant de localiser un article de grande valeur caché quelque part par un criminel arrêté. Pendant ce temps, le Député du Congrès Flemming essaye de persuader le Directeur Vance de poursuivre une carrière politique.

S14 E18 • Un devoir de mémoire

Pour réaliser le souhait d'un marin mourant, Gibbs et son équipe du NCIS ré-ouvrent une enquête sur un meurtre qui avait été classé comme un accident. Pendant ce temps, l'affaire rappelle à Torres un moment tragique de son passé.

S14 E19 • Les cavaliers solitaires

Quand un Marine est assassiné lors d'un évènement pour l'Honor Flight Network, un organisme à but non lucratif qui organise pour les vétérans de visiter la Mémorial sur la Seconde Guerre Mondiale, le Mémorial des Guerres de Corée et du Vietnam gratuitement, l'équipe du NCIS doit s'appuyer sur un vétéran de la guerre du Vietnam, Henry Rogers pour fournir des détailes sur la localisation de la victime tout au long de la journée. Pendant ce temps, McGee et Bishop enquêtent sur une rumeur juteuse sur Quinn et Torres.

S14 E20 • Coup de froid

Après que l'ordinateur d'un vice-amiral est infecté par un logiciel de rançon, il enrôle McGee et l'équipe du NCIS pour retrouver le hacker avant que le virus élimine ses dossiers personnels et professionnels. Pendant ce temps, Alex prend des congés pour aider sa mère, Marie Quinn après avoir reçu un SMS d'aide.

S14 E21 • Le droit à l'erreur

Torres doit s'appuyer sur de vieux cahiers et contacts après que le meurtre d'un Marine est lié à un ancien groupe de vaisseaux de terre qu'il a rejoint pour une opération d'infiltration pendant un an.

S14 E22 • A l'état sauvage

Après qu'un sergent des marines est retrouvé assassiné dans le Parc National, Gibbs et son équipe font équipe avec le sergent de la police monté May Dawson pour résoudre une série de meurtre liée au parc.

S14 E23 • Une grande occasion

Le stress du mariage imminent de McGee et Delilah laisse des traces alors que Delilah est transportée à l'hôpital. Pendant ce temps, l'équipe du NCIS se rend en mer après qu'un jeune officier en bonne santé d'un destroyer est mort dans son sommeil.

S14 E24 • Un pour tous...

Gibbs, McGee et Torres se rendent dans une région éloignée au Paraguay, contrôlée par un groupe de rebelles violents, dans le but de localiser un Navy SEAL disparu lors d'un voyage non autorisé.