S3 E1 • La cage du soleil

Pendant un exposition sur l'Égypte Ancienne au British Museum, une anomalie est découverte dans un monument appelé la Cage du soleil et une créature nommée Pristichampsus, un crocodile préhistorique s'en échapppe. Il sort du musée et sème la panique en ville.

Première diffusion : 28 mars 2009

S3 E2 • Prédiction

5 ans plus tôt, dans une maison, trois jeunes viennent s'amuser. Ils sont attaqués par une créature puis disparaissent. De nos jours, au CRA, Cutter a réalisé un modèle 3D représentant toutes les anomalies connues à travers l'histoire, leur permettant de prédire où et quand les prochaines anomalies apparaîtront. Après un dernier calcul, ils prédisent la première. Jenny, Abby et Connor se rendent aus coordonnées indiquées par Cutter, il s'agit de la maison où les trois jeunes ont disparu. Il vont faire aussi la connaissance du Détective Danny Quinn. Ensemble, ils vont résoudre le mystère.

Première diffusion : 4 avril 2009

S3 E3 • Au revoir Nick

Dans un immeuble, Helen entraine ses hommes. Elle est satisfaite de voir qu'ils obéissent sans discuter. À cause d'Helen, tout le monde est sur ses gardes au centre. De plus, un journaliste va poser des problèmes. Au CRA, Connor a réalisé un appareil permettant de refermer les anomalies. Au même moment, une anomalie est détectée dans un hôpital. Cutter, Abby, Connor et Becker auront affaire à de petites créatures nommées "Diictodon", qui rongent tout sur leur passage. Pendant ce temps, Helen envahie le CRA, grâce à un clone de Nick Cutter. Réussiront-ils à s'en sortir, une fois encore?

Première diffusion : 11 avril 2009

S3 E4 • L'attaque du 737

Après la destruction du CRA et la mort de Nick Cutter, tout le monde a bien du mal à se remettre au travail. Les réparations du centre avancent bien et juste au moment où Connor termine de réparer le détecteur, une anomalie est repérée dans un bâtiment contrôlé par Christine Johnson. De retour au CRA, le détecteur repère une autre anomalie et ils se rendent sur place. Jenny et Connor vont faire confiance à un journaliste. Erreur fatale !

Première diffusion : 18 avril 2009

S3 E5 • Un champignon venu du Futur

Connor et les deux Diictodon ont dormi au CRA. L'un d'eux, appelé Sid, s'est enfui et fait des bêtises. Au même moment, l'alarme d'intrusion se déclenche. Jenny, Becker et Connor se rendent dans le secteur 7 pour l'intercepter. Ils sont surpris de voir que ce n'est autre que Danny Quinn. Plus tard, une anomalie est détectée et ils doivent faire face à un champignon un peu spécial

Première diffusion : 25 avril 2009

S3 E6 • Les prédateurs

Alors que Sarah et Connor pensent avoir trouvé la signification de l'artefact, Danny et le capitaine Becker remarquent que des caméras de surveillance sont dispersées dans le CRA. Des soldats investissent le CRA pour récupérer le mystérieux objet. L'équipe décide de se mettre à l'abri dans une vieille maison abandonnée, mais elle est victime d'une attaque de Phorusrhacos...

Première diffusion : 2 mai 2009

S3 E7 • Le dracorex

Un Dracorex franchit une anomalie et se retrouve traqué par un chevalier du Moyen-Age, lui aussi sorti d'une anomalie. L'équipe va devoir maitriser le dinosaure et se débarrasser du chevalier.

Première diffusion : 9 mai 2009

S3 E8 • Esprit de famille

L'équipe découvre une anomalie dans un hangar d'un circuit automobile, et est bientôt confrontée à un Insecte carnivore venu du futur. Jack, le frère d'Abby, complique la tâche de l'équipe en traversant l'anomalie pour échapper à un des monstres... l'équipe part en expédition dans le futur pour le sauver.

Première diffusion : 16 mai 2009

S3 E9 • La revanche d'Helen Cutter

Une horde de Brontotheriums, rhinocéros préhistoriques franchit une anomalie. Pendant ce temps, Danny rencontre Eve, une mystérieuse femme apparemment venue du futur.

Première diffusion : 23 mai 2009

S3 E10 • Retour aux sources

Helen, toujours plus folle, remonte le temps grâce aux anomalies pour exterminer les premiers hominidés, et donc la race humaine. L'équipe se lance à sa poursuite dans une folle course-poursuite contre et à travers le temps.

Première diffusion : 30 mai 2009