S5 E1 • Vortex

Kara est surprise de découvrir que CatCo a un nouveau propriétaire qui se trouve être un journaliste star. De nouveaux couples émergent et ils apprennent à construire leur relation pendant que J'onn J'onzz reçoit un visiteur inattendu.

S5 E2 • Travail sur soi

Supergirl, Alex et Brainiac contrecarrent une attaque alien pendant que William enquête sur Kara. J'onn J'onzz et Kelly utilisent la technologie d'Obsidjan pour résoudre un problème.

S5 E3 • Prise de contrôle

Kara essaye de réparer sa relation avec Lena. J'onn J'onzz fait un plongeon dans sa mémoire pendant que Kelly essaye d'aider un vieil ami.

S5 E4 • À la poursuite de Maléfic

L'enquête de Kara sur les activités "criminelles" William Dey résulte sur une révélation choquante sur le fait qu'il n'est pas ce qu'elle croyait. Pendant ce temps, le conflit entre Malefic et J'onn J'onzz atteint un point de non-retour.

S5 E5 • Liaisons dangereuses

A la veille du lancement mondiale des lentilles de contact de réalités virtuelle d'Andrea Rojas, Kara et William font équipe sur une enquête pour exposer un complot terroriste. Kelly et Alex celèbre un anniversaire mais la sécurité d'Alex est mise en péril.

S5 E6 • Le médaillon d'Acrata

Acculée par Léviathan qui l'a chargé de tuer Rip Roar, toujours retenu au DEO et protégé par Supergirl, Andrea décide de tout avouer à Lena et raconte comment elle a dû trahir une amie de 10 ans lors d'une quête commune autour d'une légende qui obsédait la mère de Lena.

S5 E7 • Fusion

Margot tente de tuer Lena et récupérer son médaillon au nom de Léviathan ; devant son échec, Rama Khan, le chef du groupe, décide d'agir par lui-même. Se sachant ciblée, elle va de nouveau manipuler Supergirl pour qu'elle la mène à la Forteresse de Solitude et mette la main sur les armes qui y sont gardées. L'explosion d'une bombe de Léviathan blesse Alex et endommage un des inhibiteurs de Brainy. J'onn découvre que son frère est encore à National City et dans une communion, l'esprit de son père l'enjoint à tout risquer pour tenter de le sauver.

S5 E8 • La colère de Rama Khan

Supergirl a découvert la duplicité de Lena Luthor et s'interroge sur ses plans pour Myriad. J'onn, réconcilié avec son frère, a la réponse : elle veut utiliser le pouvoir d'inception de Ma'alefa'ak sur l'humanité pour la libérer de ses travers. Au même moment, Rama Khan veut profiter d'un événement cosmique pour décupler ses pouvoirs et déclencher le réveil d'un super-volcan sur National City. Kara reste persuadée de ramener son amie à la raison mais elle s'oppose à Alex, prête à prendre des mesures radicales.

S5 E9 • Crisis on Infinite Earths : La menace (1)

La crise a commencé : une vague d'anti-matière s'apprête à détruire le multivers, frappant Terre-9, Terre-89, Terre-66 et Terre-X. Le premier combat aura lieu sur Terre-38, où Supergirl voit la cité flottante d'Argo être détruite depuis la Terre. Cependant, Lyla, devenue Harbinger, ramène Lois et Clark à National City, alors qu'ils étaient prêts à se sacrifier pour sauver leur fils nouveau-né, puis rassemble les héros de Terre-1 : Oliver Queen et sa fille Mia, Barry Allen, Kate Kane, Sara Lance et Ray Palmer. Alors que les combattants protègent la tour quantique qui maintient l'anti-matière au large, l'évacuation commence.

S5 E10 • La capsule

Kara essaie de s'adapter aux répercussions de la crise qui a donné naissance à Terre-Prime. Supergirl a du mal à accepter le fait que Lex Luthor soit considéré comme un saint aux yeux de tous. Ce dernier tente de se réconcilier avec Lena et Lillian. L'une des conséquences de la crise est la présence de plusieurs jumeaux astraux de Brainiac-5 et l'un d'entre eux meurt.

S5 E11 • Retour du futur, première partie

Brainy accepte d'aider Lex dans son combat contre Léviathan, mais garder le secret lui pèse. Il doit donc rester en retrait quand le milliardaire capture un Winslow Schott d'une autre Terre où il est devenu le nouveau Toyman et lui offre les moyens de provoquer, provoquant le retour de Winn depuis le futur. Kara essaie de protéger William, qui soupçonne la duplicité de Lex.

S5 E12 • Retour du futur, deuxième partie

Winn s'apprête à repartir au XXXe siècle quand le DEO découvre que son double a réussi à se télécharger dans les serveurs de l'agence, prenant le contrôle de leur armement et leur infrastructure. Lex Luthor y voit l'opportunité de devenir immortel et faire jeu égal avec Léviathan, et charge donc Brainy de récupérer le code de Toyman. Lex aide également Lena à se rapprocher d'Andrea Rojas et Obsidian en allant directement à la rencontre de Gamemnae.

S5 E13 • Réécrire l'histoire

Mxyzptlk fait une drôle de proposition à Kara. Si elle pouvait remonter le temps et dire à Lena son secret avant Lex, les choses seront-elles différentes ? A travers de nombreux flash-backs, Kara doit décider si elle veut changer le cours de l'histoire et redevenir amie avec Lena.

S5 E14 • La garde du corps

Lex charge Supergirl de protéger Andrea d'un extrémiste anti-technologie, mais ce but cache un autre beaucoup plus néfaste. Pendant ce temps, Lena avance avec Non Nocere, avec l'aide de Lex.

S5 E15 • Monde virtuel, haine réelle

La colocataire de Nia, Yvette, est attaquée par un homme qui cible Dreamer parce qu'il n'aime pas que cette dernière soit un super-héros transgenre. Déterminée à protéger sa communauté, Dreamer refuse de céder à ses menaces. Supergirl et Brainy viennent en aide à Dreamer. Pendant ce temps, Alex, J’onn et Kelly tentent de secourir un homme coincé dans un escape game.

S5 E16 • Alex au pays des merveilles

Alex utilise une paire de lunettes pour visiter une ville virtuelle où elle se prend pour une nouvelle personne. Pendant ce temps, Kelly aide William à enquêter sur Lex et Kara fait face à des nouvelles difficiles.

S5 E17 • Deus Lex Machina

Lex a accédé au pouvoir après la Crise. Il procède à l'élaboration d'un plan complexe pour rapprocher Lena de lui, vaincre la dernière attaque de Leviathan et opposer Supergirl et son équipe contre Leviathan.

S5 E18 • Le chaînon manquant

Supergirl et l'équipe partent pour un face à face contre Rama Khan et Leviathan. Pendant ce temps, Lena et Lex doivent s'unir quand le projet "Non Nocere" échoue, laissant la fratrie en sérieux danger.

S5 E19 • Combat d'immortels

Supergirl réalise que pour stopper Lex et Leviathan, elle doit travailler avec la personne à qui elle ne pensait jamais pouvoir de nouveau faire confiance : Lena. Nia n'arrête pas de rêver de Brainy mais elle n'arrive pas à comprendre ce que ses rêves veulent lui dire. Pendant ce temps, Brainy comprend qu'il n'y a qu'une seule solution pour arrêter Lex.