S3 E1 • Au nom des miens

Un criminel dangereux fait irruption du passé de Danny pour se venger et enlever Jackie. Pendant ce temps, Jamie rencontre son nouveau partenaire, alors qu'un jeune officier est ébranlé après avoir tiré accidentellement sur un homme innocent.

S3 E2 • Au-dessus des lois

Lorsque une femme blessée retire sa plainte pour violence conjugale, Danny et Jackie regarde cette affaire d'un peu plus près, et découvrent que la femme en question est impliquée dans une relation secrète avec un conseiller haut placé, qui se trouve aussi à être un ami de Frank. Pendant ce temps, Linda retourne au travail, ce qui ne manque pas de bouleverser Danny.

S3 E3 • La solution des lâches

Danny croit qu'un tueur en série est en fuite lorsque deux victimes de crimes trouvées séparément sont identifiées comme membres d'un groupe accusé d'un viol collectif. Pendant ce temps, l'ex-mari d'Erin, le procureur Jack Boyle, refait surface dans la vie de cette dernière tandis qu'ils s'affrontent en cour.

S3 E4 • Le plus beau jour de leur vie

Danny et Jackie enquêtent sur le meurtre d'une jeune femme abattue par un gang le jour de son mariage. Ils se voient retirer le dossier et assignés à la protection d'un président sud-américain, qui pourrait être la cible d'une menace d'assassinat.

S3 E5 • La Médaille du Courage

De retour d'une mission d'infiltration en Malaisie, l'officier Bobby Mulrow est décoré par Frank. Mais quelques heures à peine après cette cérémonie, ce héros de guerre est kidnappé ! Les ravisseurs, agissant au nom du trafiquant de drogue Omar Sayid, exigent la libération du frère de ce dernier, Abdul, détenu à New York. Pour Frank, les instructions de sa hiérarchie sont limpides : aucune négociation avec des terroristes n'est autorisée. Une course contre la montre pour retrouver Bobby commence, et elle est menée par un Danny particulièrement nerveux. Henry, le patriarche de la famille Reagan, fête le 60ème anniversaire de son entrée dans les forces de l'ordre de New York en accompagnant Jamie durant 2 jours sur le terrain, dans les rues de Big Apple. Le choc entre ces deux générations de flics est rude, surtout pour Jamie...

S3 E6 • Bad boy Bradley

Menacé de mort, le témoin principal d'une affaire menée par Erin est placé sous la protection continue de Danny. Une tâche rendue difficile par le comportement de ce photographe mondialement connu et particulièrement inconscient... Comme si cela ne suffisait pas, Linda et Danny font face à des problèmes financiers devenus critiques. Le couple n'a même plus d'argent pour payer les réparations nécessaires pour une de leurs voitures. Jamie et son partenaire Vinny arrêtent des dealers de marijuana grâce aux tuyaux donnés par une vendeuse de bijoux à la sauvette. Mais cette dernière n'est pas ce qu'elle semble être... A la maison, Frank tente de faire comprendre à Henry qu'il n'est plus apte à conduire. Comme il s'y attendait, la fierté du patriarche Reagan s’accommode mal de cette remise en question...

S3 E7 • Halloween vaudou

C'est Halloween à New York ! Les enfants déguisés défilent dans les rues à la recherche de bonbons et les adultes jouent à se faire peur. Dans une ruelle, le jeu se transforme en tragédie : un homme déguisé en prêtre se fait attaquer par un individu grimé en "Baron Samedi", l'esprit de la Mort dans la tradition haïtienne. Flanqué d'une nouvelle partenaire spécialiste de la culture vaudou, Danny est chargé de l'enquête... Victime d'extorsion, Garrett, l'attaché de presse de Frank, est poussé à la démission... Enfin Jamie se prend de sympathie pour un individu non identifié, visiblement atteint d'Alzheimer...

S3 E8 • La bonne éducation

Nicki désire aller à une fête organisée par des étudiants mais sa mère Erin se montre inflexible : sa fille est trop jeune et cette soirée pourrait dégénérer sans contrôle parental. Frank se retrouve malgré lui au milieu de chamaillerie et sa voix pourrait faire basculer la balance... Alors qu'il est en train de boucler un délinquant, Jamie retrouve une ex-camarade d'université, Dana. Devenue courtière à Wall Street, elle est toujours perplexe par rapport au choix de carrière du jeune Reagan. Danny enquête sur la mort d'un étudiant sur le campus. La victime semble avoir été victime d'un règlement de comptes suite à une affaire de drogue. Pour mener son investigation, il va devoir faire équipe avec Eddie Stone, un agent de la DEA particulièrement nerveux...

S3 E9 • Un Justicier dans la ville

Danny et Kate enquêtent sur la mort par balle de Michael Reade, un ancien repris de justice qui comptait bon nombre d'ennemis dans son entourage comme ailleurs.

S3 E10 • Pères et Fils

Alors qu'il fait du vélo avec Erin et Nicky, Sean, le fils de Danny, fait une chute et se blesse gravement à la tête.

S3 E11 • L'Alternative

Un individu menaçant a été aperçu dans un parc. L'homme aurait été vu pointant une arme en direction de la foule.

S3 E12 • Pris au piège

Danny est en mauvaise posture. Un sac de cocaïne a été découvert dans le coffre de sa voiture lors d'un contôle policier.

S3 E13 • La déesse et les rats

Danny travaille désormais avec une nouvelle coéquipière, Candice McElroy, alias Mac. Cette dernière, qui a eu une carrière militaire avant d'intégrer la police, s'est plusieurs fois rendue en Afghanistan au cours de sa vie.

S3 E14 • Instinct paternel

Levi, le fils d'un grand rabbin, est assassiné alors qu'il s'apprêtait à succéder à son père dans ses fonctions.

S3 E15 • Terre d'asile

Devon Williams, un enfant de 10 ans, est grièvement blessé par balles lors d'une fusillade. Danny prend l'affaire en main et se lance à la recherche de son agresseur, tout en essayant de gérer sa colère.

S3 E16 • Quid Pro Quo

Erin est contactée par un homme qui sollicite son aide pour enquêter sur une affaire vieille de quinze ans.

S3 E17 • Bonnie & Clyde

Un policier en civil tente de s'interposer au cours du braquage d'une banque entre les malfaiteurs et les clients.

S3 E18 • Le poids des regrets

Danny et Maria Baez cherchent à arrêter un tueur qui a déjà causé la mort de deux personnes, mais ils se heurtent à un problème de taille : il s'avère très difficile d'établir un lien solide entre les deux victimes.

S3 E19 • Crise de foi

Le corps d'une jeune fille est découvert au beau milieu d'un cimetière. Le cadavre porte un cricifix entre les mains et semble avoir été préparé pour une inhumation.

S3 E20 • Tous les coups sont permis

Alors que Danny s'apprête à appréhender un trafiquant de drogues, un individu qui accompagnait le dealer ouvre le feu et touche son complice dans la fusillade.

S3 E21 • Le souffle du diable

Lorsque Danny trouve un homme désorienté dans un parc couvert du sang de sa petite amie, il a du mal à croire que l'homme n'a aucun souvenir des événements de la nuit jusqu'à ce qu'ils trouvent un fort narcotique dans son sang. Pendant ce temps, Jamie a des ennuis quand il aide un officier de repos à dissimuler son ivresse après avoir arrêté un voleur armé.

S3 E22 • Le bout de la ligne (1-2)

Danny est émotionnellement touché quand une jeune femme se suicide car il a promis de l'aider quand ses parents lui ont été enlever. Pendant ce temps, Frank souffre d'une perte due au projet des gangs.

S3 E23 • Le bout de la ligne (2-2)

Danny continue son enquête sur la bande «Los Lordes». En compagnie de Baez, il se lance à la poursuite de la voiture de Santana. Grâce au mandant pour perquisitionner le véhicule, ils découvrent de la drogue planquée à l'intérieur...