Metamor Panic: Doki Doki Yōma Busters!! est un jeu d'aventure de type visual novel avec des éléments de RPG. Les scènes d'aventure se déroulent principalement de manière linéaire, le joueur étant parfois invité à choisir une action, comme le sujet de sa question à un personnage ou l'examen d'un objet. Des séquences de combat, au tour par tour, s'intercalent également, où les trois personnages affrontent des yōkai.