S3 E1 • Les innocents(1)

Frank croit que l'accident d'un avion à réaction est lié à l'épidémie qui a tué sa femme. Avec sa fille, Jordan, il est retourné aux Falls Church en Virginie. Frank doit se soumettre à une évaluation psychiatrique exigée par le FBI. Comme le Docteur Luanne Chase y assiste, Frank insiste sur le fait que Catherine et toutes les autres personnes mortes des suites de l'épidémie ont été en fait assassinées. Il avoue aussi qu'il est un peu angoissé à l'idée de revenir au travail. D'autant qu'il commence à avoir des visions de l'accident d'avion…

Première diffusion : 2 octobre 1998

S3 E2 • Exégèse

Frank et Emma observent les sauveteurs qui tentent d'extraire les corps d'une femme et d'une petite fille des décombres d'un pont. Entre-temps, à l'hôpital, Mary a une attaque. Les médecins et les internes interviennent et surveillent l'électroencéphalogramme qui fluctue… jusqu'à ce que Mary revienne finalement à la vie…

Première diffusion : 9 octobre 1998

S3 E3 • Ceux qui survivront

Lors d'une fête d'étudiants dans le gymnase de l'école des coups de feu sont tirés. Trois étudiants sont tués. Les agents Baldwin et Hollis sont chargés de l'enquête. L'inspecteur de la police de Seattle, Giebelhouse, leur explique que les coups de feux ont été tirés de dessous les gradins. Il fait appel à Frank Black. Les soupçons se posent sur Brant Carmody, un étudiant introverti. Lorsque les agents se présentent à son domicile un coup de feu retenti, Brant s'est suicidé…

Première diffusion : 16 octobre 1998

S3 E4 • Trauma

Emma is haunted by memories of the death of her sister while she and Frank hunt a spree killer.

Première diffusion : 23 octobre 1998

S3 E5 • Treize ans plus tard

Un réalisateur, Lew Caroll et une actrice, Marta Dunbury, sont poignardés dans leur chambre d'hôtel. Frank et Emma sont envoyés sur place pour enquêter. Dans la chambre, Frank a des flashs du groupe Kiss. Il découvre ensuite avec stupeur que Lew Caroll tournait un film autobiographique qui portait plus précisément sur une série de crimes sur lesquelles il avait enquêté treize ans plus tôt.

Première diffusion : 30 octobre 1998

S3 E6 • Ossements

Frank recherche des indices quand un homme bizarre révèle des détails compliqués sur des victimes découvertes dans une tombe commune.

Première diffusion : 6 novembre 1998

S3 E7 • Recommencement

Lorsqu'un homme qui moleste les enfants est libéré de prison, les pires conséquences sont à prévoir. Frank n'est pas dans de très bonnes dispositions. Il vient tout juste d'apprendre qu'un condamné va prochainement être libéré. Il est persuadé que cette remise de peine n'est pas une bonne chose et que l'inculpé retombera dans ses anciens travers. Les conséquences pourraient être très graves dans la mesure où celui-ci a autrefois été accusé d'avoir molesté des enfants. Lâché en pleine nature, considéré comme un malade, il ne pourra sans doute pas résister à ses pulsions perverses. Frank se montre prêt à tout pour éviter un nouveau drame

Première diffusion : 13 novembre 1998

S3 E8 • Démons intérieurs

Une jeune femme perturbée clame que l'héroïne vendue par un dealer change les toxicomanes en monstres. Une jeune femme souhaite avertir la population d'un grave danger. D'après ses dires, l'héroïne vendue par un dealer transformerait les toxicomanes en monstres. Celle qui profère de telles allégations ne semble pas digne de confiance dans la mesure où tous ceux qui entendent ses paroles pensent qu'elle a perdu la tête. Toutefois, Frank pense qu'il serait judicieux de vérifier ses affirmations, en commençant par le début : retrouver le revendeur concerné, le suivre ou mettre la main sur quelques clients qui auraient fait les frais de la substance aux effets délétères

Première diffusion : 11 décembre 1998

S3 E9 • Omerta

Frank et Jordan voyagent dans le Vermont où ils rencontrent un gangster qui, apparemment, aurait ressuscité. Pour passer les fêtes de Noel, Frank décide d'emmener son fils Jordan dans la petite ville de Coker Creek, en plein coeur du Vermont. Quand ils arrivent, un homme est découvert errant à moitié nu dans la forêt. Pour tout vêtement, il porte une veste tachée du sang d'Eddie Scarpino. Ce dernier a disparu mystérieusement quelques années plus tôt. L'homme retrouvé dans la forêt s'appelle Al Ryan et se souvient d'avoir été attaqué par un loup au cours d'une partie de chasse. Après c'est le trou noir

Première diffusion : 18 décembre 1998

S3 E10 • Sursis

Jordan, la fille de Frank Black, tombe subitement malade pendant l'un de ses cours.Pendant un de ses cours, Jordan, la fille de Frank Black, tombe gravement malade, sans que personne n'ait remarqué de signes précurseurs. Frank fait alors le rapprochement avec plusieurs cas similaires, survenus précédemment. Trois personnes, frappées elles aussi d'une maladie grave, avaient frôlé la mort, puis disparu dans de mystérieuses circonstances. Frank doit résoudre cette énigme s'il veut sauver sa fille

Première diffusion : 15 janvier 1999

S3 E11 • Lésions de guerre

Un vétéran kidnappe la fille de Watts dans de but de révéler l'implication du groupe Millennium dans la Guerre du Golfe.

Première diffusion : 22 janvier 1999

S3 E12 • Le bruit de la mort

Franck reçoit une mystérieuse cassette et ne tarde pas à faire le lien entre celle-ci et la mort étrange de deux personnes.

Première diffusion : 5 février 1999

S3 E13 • Antipas

Frank découvre de curieux points communs entre le procureur fédéral, un candidat au poste de gouverneur... et la terrible Lucy Butler.

Première diffusion : 12 février 1999

S3 E14 • Matrioshka

Frank et Emma étudient le suicide apparent d'un ancien agent du FBI qui enquêtait sur la mort mystérieuse d'un physicien nucléaire en 1945.

Première diffusion : 19 février 1999

S3 E15 • Forcer le destin

Franck et Emma sont sur les traces d'un groupe de fanatiques religieux qui ont kidnappé une femme juive enceinte.

Première diffusion : 19 mars 1999

S3 E16 • Jordan contre Lucas

Jordan a des visions étranges quand une famille emménage dans le voisinage.

Première diffusion : 9 avril 1999

S3 E17 • L'oeil de Darwin

Une chasse à l'homme est engagée après l'évasion d'un malade mental soupçonné d'avoir décapité deux personnes.

Première diffusion : 16 avril 1999

S3 E18 • Bardo Thodol

Frank et Emma mènent l'enquête quand cinq mains coupées sont retrouvées à bord d'un cargo japonais.

Première diffusion : 23 avril 1999

S3 E19 • Sept ans de malheur

Quand Franck affirme que quelqu'un essaie de le tuer, les autorités le soupçonnent de faire une dépression nerveuse.

Première diffusion : 30 avril 1999

S3 E20 • Nostalgie

Frank et Emma enquêtent sur le meurtre de plusieurs jeunes femmes dans la petite ville où Emma a grandi.

Première diffusion : 7 mai 1999

S3 E21 • Le chemin de croix

Frank poursuit un tueur en série dont le modus operandi est similaire à celui d'un meurtrier exécuté sur la chaise électrique. Watts propose à Emma de venir en aide à son père malade.

Première diffusion : 14 mai 1999

S3 E22 • La fin d'un temps

A la suite de l'explosion de l'appartement, Barry Baldwin, blessé, est transporté en ambulance. Mais durant le voyage jusqu'à l'hôpital, un médecin enfonce délibérément un bout d'éclat dans sa poitrine

Première diffusion : 21 mai 1999