S3 E1 • Le Phare de l'angoisse

Les habitants d'une petite ville du Midwest sont effrayés par les fantômes qui hantent un vieux phare abandonné.

Première diffusion : 29 janvier 2005

S3 E2 • Scooby-Doo au Far-West

Scooby Doo et ses amis décident de séjourner dans un parc, tenu par des robots, où l'on peut vivre des aventures comme dans films Westerns. C'est alors qu'un des robots se retourne contre l'équipe.

Première diffusion : 5 février 2005

S3 E3 • Combats Déments

Un étrange lutteur connu sous le nom de Titanic Twist, doté de deux bras d'un côté, terrorise les matchs de catch.

Première diffusion : 12 février 2005

S3 E4 • A Vos Marques... Pleurez !

La bande est à Paris pour voir Dannika, la cousine de Daphné, remporter le prix du « mannequin de l'année », mais ils découvrent qu'elle a été enlevée lorsqu'une gargouille de la cathédrale Notre-Dame a pris vie. Les enfants doivent maintenant la retrouver en fouillant les catacombes de Paris, les égouts et la cathédrale avant le début du salon de la mode.

Première diffusion : 19 février 2005

S3 E5 • Le Démon de la Ferme

La bande se rend chez les Secret Six Puppies, mais découvre bientôt quelque chose de terrible. Un mystérieux fermier démon hante leur ferme construite sur un ancien cimetière et veut que les chiots disparaissent. La bande reste pour aider, lorsque tous les ouvriers agricoles ont démissionné.

Première diffusion : 26 février 2005

S3 E6 • Les Monstres préfèrent les Diamants

En Russie, le gang découvre le Frozen Fiend, une créature goule qui a volé la Coupe de l'Empereur, qui serait remise au vainqueur du Tournoi International de Hockey ?

Première diffusion : 5 mars 2005

S3 E7 • Une partie de golf infernal

Le tournoi international de mini-golf est organisé autour d'un 18e trou et d'un clown de style MONSTRE, mais c'est une bonne et une mauvaise nouvelle pour Mystery Inc. à l'écran. La mauvaise nouvelle, c'est que le génie de la bande, Velma, a une phobie des clowns, mais la bonne nouvelle, c'est que Norville "Sammy" Rogers agit avec courage ! Saintes réserves, Scooby-Doo ! La bande parviendra-t-elle à résoudre le mystère et à faire revenir Velma et Sammy ?

Première diffusion : 12 mars 2005

S3 E8 • Le Camp viensdoncquejetefassepeur

Un monstre connu sous le nom de The Toxic Terror attaque le terrain de camping préféré de Sammy, Scooby et 3 enfants.

Première diffusion : 19 mars 2005

S3 E9 • Les Tribulations de Sammy et Scooby-Doo en Chine

Mystery Inc. se retrouve impliquée dans un mystère mettant en scène un dragon géant, un ancien employé en train de se défoncer, une bague en bonbons volée dans les magasins de jouets Lui-Won, un policier fou et des jouets géants mutants. Velma parviendra-t-elle à découvrir qui se cache derrière ce mystère insensé ?

Première diffusion : 26 mars 2005

S3 E10 • A fond les ballons

Les Mystery Kids se dirigent vers une course de championnat de type NASCAR où le chaos règne sur les pistes de course.

Première diffusion : 2 avril 2005

S3 E11 • Midas chez les bidasses

La bande rend visite aux Sacred Six (vus à l'origine dans Homeward Hound et Farmed and Dangerous) lorsqu'ils apprennent qu'un malfaiteur appelé Gold Paw transforme les gens en or pour voler de l'or. Lorsque l'un des Sacred Six est transformé en or, la bande de Mystery, Inc. doit résoudre cette affaire avant que les cinq autres ne subissent le même sort !

Première diffusion : 9 avril 2005

S3 E12 • Des griffes sous le récif

Une créature issue d'un récif corallien attaque un concours de châteaux de sable en Australie. Les participants commencent à disparaître dans le sable.

Première diffusion : 16 avril 2005

S3 E13 • Frayeur Virtuelle

La bande visite une convention de jeux vidéo pour jouer aux jeux vidéo, mais les mignonnes créatures Osomon qui étaient le point culminant du spectacle se transforment en monstres.

Première diffusion : 21 juillet 2006