S1 E1 • Bienvenue

Les agents des services secrets Lattimer et Bering sont transférés dans le top secret entrepôt 13. Ils y rencontrent Artie Nielsen, le responsable du mystérieux entrepôt qui leur explique qu'ils sont dorénavant responsables d'objets surnaturels collectés par le gouvernement. Pour leur première mission, ils sont envoyés en Iowa pour enquêter sur un artéfact appartenant à un étudiant qui a agressé sa petite amie en récitant une incantation en italien.

Première diffusion : 7 juillet 2009

S1 E2 • Résonances

Pete et Myka doivent enquêter sur des braquages de banques ayant lieu à Chicago. Les braqueurs hypnotisent leurs victimes grâce à un artefact.Artie, quant à lui, doit faire face à une tentative de piratage de l'Entrepôt.

Première diffusion : 14 juillet 2009

S1 E3 • Magnétisme

Myka et Pete se rendent à Unionville où certains habitants ont des comportements excessifs. Ils doivent trouver rapidement ce qui provoque de tels excès pour sauver la vie des personnes concernées. De son coté, Artie s'occupe des problèmes de courts circuits dans l'entrepôt.

Première diffusion : 21 juillet 2009

S1 E4 • Claudia

Artie est enlevé par Claudia, pirate de l'Entrepôt et soeur d'un de ses anciens étudiants disparu douze ans plus tôt. Elle est convaincue que son frère n'est pas mort, mais seulement coincé dans une autre dimension par un artefact sur lequel il travaillait. Elle demande de l'aide à Artie. Lattimer et Bering se lancent à sa recherche.

Première diffusion : 28 juillet 2009

S1 E5 • Légendes indiennes

Des sculptures représentant les quatre éléments et dont la légende dit qu'elles formeraient une carte menant à une grotte sacrée sont dérobées. Un artefact amérindien serait impliqué dans ces vols. Lattimer et Bering, aidés d'Artie et de Claudia, enquêtent. Leurs soupçons se tournent vers deux collectionneurs rivaux : Gilbert Radburn et Jeffrey Weaver.

Première diffusion : 4 août 2009

S1 E6 • La main de dieu

Une explosion a lieu dans un commissariat de Saint-Louis faisant six morts. Lattimer et Bering se rendent sur place et découvrent le corps d'un ancien agent de l'Entrepôt. Au cours de leur enquête, ils rencontrent son ancienne partenaire qui leur révèle le côté sombre de l'Entrepôt.

Première diffusion : 11 août 2009

S1 E7 • Le sabre

A Washington, un sabre japonais ayant la capacité de rendre son possesseur invisible est dérobé sous les yeux de Lattimer et Bering. Tandis qu'Artie se lance à la poursuite du voleur, qui ne serait autre qu'un ancien membre de la section, son passé ressurgit.

Première diffusion : 18 août 2009

S1 E8 • Reflet trompeur

Le miroir de Lewis Carroll, une boule disco du Studio 54… L’inventaire dans la Warehouse 13 crée quelques tumultes, alors que Pete et Myka doivent partir à Las Vegas pour retrouver un artefact en possession d’un couple de voleurs.

Première diffusion : 25 août 2009

S1 E9 • Remords

Quand quatre prisonniers se suicident en peu de temps dans une prison de haute sécurité, Artie envoie Pete et Myka enquêter.

Première diffusion : 1 septembre 2009

S1 E10 • Tout va très bien

Pendant que Pete, Myka et Claudia sont coincés dans l'entrepôt, Artie se voit obligé de répondre à ses supérieurs.

Première diffusion : 8 septembre 2009

S1 E11 • Le pouvoir des mots

Le père de Myka, Warren reçoit un livre datant du XIXème siècle. Il est intrigué jusqu'au moment où la lettre lui rentre sous la peau. Myka chasse MacPherson qui semble s'amuser ouvertement avec Pete et celle-ci quand on lui annonce que son père est en train de mourir.

Première diffusion : 15 septembre 2009

S1 E12 • Vente aux enchères

L'équipe apprend que McPherson vend aux enchères des objets qu'il a volé de l'entrepôt. Pete et Myka partent une nouvelle fois à sa nouvelle poursuite.

Première diffusion : 22 septembre 2009