Dans un New York où règnent la drogue, les tueurs à gage, les guerres de gangs et les flics véreux, Luc Besson signe son sixième long-métrage intitulé Léon.
Ce tueur à gage professionnel (interprété par Jean Reno), ou "nettoyeur" comme il aime se faire appeler, va faire la rencontre d'une petite fille de 12 ans dont la famille a été tué par une brigade des stupéfiants, Matilda, (Natalie Portman, qui lance ainsi sa future grande carrière), qu'il va prendre sous son aile.
La jeune fille au fort caractère va tenter d'apprendre les ficelles du métier sous la tutelle de Léon, et une relation ambiguë va naître entre les deux personnages, Matilda étant vraisemblablement atteinte d'un complexe d'Électre. Pour le solitaire Léon, pour qui la seule femme qu'il n'a jamais aimé est morte alors qu'il était très jeune (scène seulement présente dans la version longue), et ayant pour seule amie une plante verte, cette rencontre le chamboule totalement, et n'ayant jamais appris à lire ou à écrire, mais seulement à "nettoyer" de façon pro, c'est alors la jeune fille qui lui fait faire des dictées.
Rôles inversés, tabous de l'inceste exploré, Luc Besson, malgré un scénario somme toute assez classique (meurtre de famille et vengeance), s'illustre en tant que grand réalisateur qu'il est en proposant un film bourré de scènes d'action épiques et de moment de tendresse, mais qui ne lasse pas car finalement assez court (1h43).